Marina alemana
Como Turquía fue neutral durante la Segunda Guerra Mundial, el Eje no pudo transferir buques de guerra al mar Negro a través del Bósforo. Sin embargo, varios pequeños barcos fueron transportados desde el mar del Norte mediante de redes de ferrocarril, y canales al Danubio. Entre estos estuvieron seis submarinos tipo IIB de la 30ª Flotilla de submarinos enviados a Rumania por piezas y luego reensamblados en el astillero rumano Galați a finales de 1942 y posteriormente enviados a Constanza.
Los alemanes también transportaron 10 buques S (Schnellboote) y 23 barcos R (Räumboote) por el Danubio y construyeron barcazas armadas y KTs (Kriegstransporter, literalmente transportes de guerra) en los astilleros Nikoláiev capturados en Mikolaiv. Algunos otros barcos se obtuvieron de Rumania, Bulgaria y Hungría, y luego se convirtieron para servir a la causa alemana.
Se construyeron otros buques en astilleros alemanes o locales, capturados de los soviéticos o transferidos del Mediterráneo como buques mercantes. En total, las fuerzas navales alemanas que se enfrentaron a la URSS en el mar Negro ascendían principalmente a 6 submarinos costeros, 16 lanchas S, 23 lanchas R, 26 cazasubmarinos y más de 100 barcazas MFP. La flota alemana del mar Negro acabó operando cientos de buques de guerra medianos y pequeños o auxiliares antes de la deserción de Bulgaria del conflicto armado. Muy pocos buques germanos fueron capaces de lograr volver a través del Danubio.
Regia Marina italiana
En mayo de 1942, a petición de Alemania, la Regia Marina desplegó cuatro lanchas motoras antisubmarinas de 24 toneladas (Motoscafo Anti Sommergibile, MAS), seis submarinos enanos clase CB, cinco lanchas torpederas y cinco lanchas motoras explosivas en el mar Negro La flotilla tuvo una campaña activa y exitosa, con bases en Yalta y Feodosia,
La mayoría de las embarcaciones italianas en el mar Negro fueron transferidas a la Kriegsmarine tras la retirada italiana del conflicto, aunque estas fueron capturadas por los soviéticos en agosto de 1944, cuando Constanza fue capturada.
Armada búlgara
A pesar del estatus neutral de Bulgaria en la guerra germano-soviética, la armada búlgara participó en tareas de escolta para proteger la navegación del Eje contra los submarinos soviéticos en aguas territoriales búlgaras. La pequeña armada búlgara consistía principalmente en 4 torpederos viejos, 3 modernos torpederos de motor construidos en Alemania, 4 torpederos construidos en Holanda, 2 caza submarinos de clase SC-1 y 3 lanchas de motor antisubmarinos.
Marina húngara
Hungría quedó sin salida al mar después de la Primera Guerra Mundial, pero algunos barcos mercantes húngaros pudieron llegar al Mar Negro a través del río Danubio. Estos fueron operados como parte de las fuerzas de transporte marítimo del Eje en el mar Negro, y por lo tanto participaron en la evacuación de las fuerzas del Eje situadas en Crimea.
Legión Naval Croata
La Legión Naval Croata se formó en julio de 1941. Inicialmente estaba compuesta por unos 350 oficiales y marineros con uniforme alemán, pero finalmente se incrementó a 900-1.000. El propósito de los croatas al enviar un contingente naval al mar Negro era evadir la prohibición de una marina adriática impuesta por los Tratados de Roma con Italia del 18 de mayo de 1941. A su llegada al Mar de Azov, logró reunir 47 buques pesqueros dañados o abandonados, en su mayoría veleros, y para atenderlos contrató a marineros locales rusos y ucranianos, muchos de ellos desertores de la marina soviética. Más tarde, la Legión adquirió 12 cazadores de submarinos alemanes y una batería de artillería costera.
Armada rumana
Las fuerzas navales rumanas en el mar Negro consistían en cuatro destructores, cuatro torpederos, ocho submarinos, tres mineros, un submarino auxiliar, tres cañoneras y un buque escuela.
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